生信用Linux教程 Lesson 9 路径查看与切换

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B站ID：Biomamba-生信基地

来源：BV1hT411F7r7

• 对于上一讲的内容，我们需要知道的是，家目录是我们最常用的工作目录就可以了，其他的知识点用到的时候回来查就可以
• 在windows系统中，大家查找文件和访问目录是很简单的，用鼠标操作图形化界面就可以了，用文件管理器去输入相应的目录也是可以的

相对路径与绝对路径

• 绝对路径：由根目录”/“开始，遍历每一个目录或文件的名字，是文件的完整坐标，在任何情况下都可以找到对应的路径和文件，例如/Volumes/FlynnSSD/blog（啊你发现了，我的博客是挂在一个外置的SSD上的，哎嘿）
• 相对路径：由当前目录开始，包括当前目录到查找对象遍历的每一个目录或文件的名字，一般来说相对路径会比绝对路径更短，比如packages/
• 相对路径的表示方法：类似于家目录用”~/“来表示，当前目录可以用”.”来表示（对，就是英文的句号），而当前目录的上一层目录可以用”..”来表示

  大家在写生信分析的工作流程，也就是pipeline的时候，为了避免工作路径的报错，推荐使用绝对路径。

pwd命令：查看当前的工作目录

• print work directory
• 避免“迷路”，有一些命令的参数和选项是可以省略的，但是如果我们省略的部份必须要有一个执行对象，那通常执行对象会在当前的工作目录下去选择，为了避免对文件进行误操作（这种误操作通常是没有win系统下的Ctrl+Z撤回的），还是请大家善用、常用pwd命令

cd命令

• 返回上一层目录，注意这里没有”/“了

  cd ..

• 返回上两层目录，同样的道理

  cd ../..

• 返回家目录，用我们之前说过的”~”

  cd ~

• 返回家目录的另外一种方法

  cd $home

• 切换到上一个工作路径

  cd -

ls命令

• ls命令后可以跟绝对路径，也可以跟相对路径
• 显示当前目录下的文件（注意不是所有文件）

  ls

• 也可以是

  ls ./

• 显示当前目录的上一级目录下的文件（注意不是所有文件）

  ls ..

• 显示当前目录的上两级目录下的文件（注意不是所有文件）

  ls ../..

ls命令后的选项

• ls命令后可以接多个参数和多个选项

-F 选项

• 比如我们可以利用-F命令，以实现快速了解ls出的各种东西的类型，运行ls -F命令后，会在后面看到各种字符，这些字符展示了ls出的东西的类型
  • “ / “——目录
  • “ * “——可执行文件
  • “ @ “——链接
  • 什么都没有——文本文件/ASCⅡ文件

-a/–all 选项

• 加上这个参数，可以显示目录下的隐藏文件，也就是文件名前有”.”的文件
• -a和–all是等价的

-l 选项

• 有很多含义，比如long，比如list，显示出来的效果是这样的
  
• 从左到右分别是
  • 文件读取的权限
  • 文件夹的大小（这里没有显示，以-表示，就算显示了也通常是错的，看看就好）
  • 文件所属的用户（如果有第二个，就加个组）
  • 文件夹内的文件数量
  • 创建日期
  • 文件名

-d 选项

• 对文件夹本身进行展示，感觉没什么意义
  

-h选项

• 让ls出来的结果以一种对人类更加友好的方式去展示，通常与-l选项合用，单纯的ls -h意义不大
  

补充：使用eza替代ls

• 友情链接：更优雅的终端教程
• 友情链接2：7个更好用的命令行工具，关于eza的教程就在这里，但推荐先看完上面的链接
• 展示一下效果（完整做完上面两个链接的教程的）
  

真正的显示文件夹大小命令：du

• 推荐结合-h选项使用
  
• 不结合-h选项的后果：没人看得懂