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科研
B站ID：做科研的大师兄
文献阅读
来源：BV1QD4y1t7Vt
- 掌握正确的，读文献方法的意义：不管是对于广大的研究生群体，还是科研大佬，想要真正获得科研思维和具备课题设计的能力，读文献都是必经之路。
SCI文献该怎么读？
读哪些文献？
- 主刊/大子刊（IF20+）：Cell/Nature/Science…：目的是获取科研热点，借鉴科研思路，学习料研逻辑。
- 10-20分文献：借鉴经典技术方法，学习经典科研套路。
- 5-10分文献：建议不看，在检索课题创新性时关注一下即可。
- 优秀博士论文：开始科研入门时一定要看。（研究生刚入门时）
读文献有哪些方法？怎么去选择？
速读文献
- 适用于刚开始进行课题研究，对于研究领域和研究方法还不熟悉的情况，这个时候我们要首先确定研究方向的关键词或者主题词，在PubMed进行文献检索，并间相关文献导入到Endnote管理软件（主要选10-20分的文献，一般200篇左右），然后集中精力，逐个阅读每篇文献的题目和摘要，同时进行记录、整理归类。通过这种方式，可以在一周内快速完成200-篇文献的阅读，从而达到在短时间内，集中快速阅读大量研究领域的文献，快速实现对研究领域的熟悉及了解，并且初步形成自己的研究思路。
跳读
- 此方法适用于开展课题研究中涉及到一些研究方法细节、引物序列、试剂信息等需要查询的情况，此时无需从头到尾读文献，在确定文献中有自己所需特定信息情况下，直击主题，可以通过在文献文件中进行查找的方式（PDE打开用ctrl+F，mac系统用cmd+F调出查找功能），快速跳到文献对应区域，获取自己信息。
精读
- 此方法适用于科研思维能力的更高阶提升，培养个人课题设升能力。通过速读大概了解研究方向和领域的前捉下，我们仍需要进一步通过更深入的文献学习，全面提升科研思维和课题设计能力。
- 此时读文献没有技巧可言，就是不断追踪研究领域最前沿的文章（主刊或大子刊，一般是IF20+以上的文献），并通篇阅读。
- 阅读Introduction部分，学习整个研究是如何切入的
- Results部分，学习整个研究的逻辑是如何逐步换递进的
- Discussion部分，学习本研究的长处和不足，以及未来研究趋势
- Methods部分，学习文章的模型、设计、各种实验条件等。
- 整体而言，文献精读是最重要的，是提升个人科研思维和课题能力最重要的途径
读文献如何提升科研逻辑思维和课题设计能力？
什么是科研逻辑思维
- 科研：提出科学问题，并针对科学问题提出解释性的科学假说，然后通过实验来验证的过程。
- 逻辑：各种事物之间的关系，比如是非、因果、上下游……
- 思维：用来构建逻辑关系的思路、想法
- 整体性的科研逻辑思维：我们应该具有一种思路，这种思路能帮助我们在科研的过程中，将事物间潜在的逻辑关系建立起来。
什么是课题设计能力
- 基于文献报道和实验结果，以及我们的逻辑推理，提出比较可行的work model的能力
- workmodel：科学假说，或者是模式图，比如下图
- 逻辑推理：主要讨论排除法和类比法
- 排除法：A分子有三个亚基，实验证明其中两个亚基是没有什么作用的，那我们就可以通过排除法推断A分子中真正有用的亚基
- 类比法：A分子上有一个特殊的结构域，这个结构域在其他蛋白上已经被报道有DNA结合能力，那我们就可以推测A分子也能结合DNA
如何通过读文献来提升科研逻辑思维和课题设计能力？
- 这里我们总结了读文献需要解决的问题，只有将这些问题融入到读文献和解析文献的过程中，我们才可能真正去读懂文献，然后将科研大佬的思维逐渐内化为自己的科研思路和课题设计能力
选题：研究是如何进行课题切入的
- 通过哪一些基础数据和哪些文献，以及逻辑推理，使得他们提出了对应的科学问题
数据分析：组学数据是如何进行挑选的
- 为了解释科学问题，做了什么实验，产生了什么数据，怎么去分析的
- 常见的：组学的分析数据，比如RNA-seq或单细胞测序，我们知道组学数据是非常庞大的，往往需要从中挑选一个切入点，切入点是怎么选择的，依据是什么
逻辑关联：研究机制是如何进行锁定的
- 各种数据的产生还是为了提出科学假说，解释科学问题来服务的，我们关注的是科学假说的机制部份是怎么确定下来的，每一环的因果关系是怎么确定下来的
整体架构串联：调控模式是如何进行架构的
模型：研究模型是如何选择的
- 对动物模型和细胞模型的要求
因果论证/逻辑是否严密：调控关系是如何证明的
- 每一小块的逻辑怎么证明，严谨性怎么保证