从基础科研五恒量三变量的内容入手
- 分子是三变量中变化最多的参数，分子类型就有很多，还要考虑修饰
- 分子从哪里来这个问题的答案很简单，要么筛，要么猜，功能基因套路研究 Lesson 4中主要讨论了了猜分子的策略，这篇文献中我们主要讨论筛的方法学
- 复习三十六策Lesson 3和三十六策 Lesson 7中，我们主要讨论了高通量筛选的策略，也就是四大组学，LncRNA的筛选就属于转录组学的范畴；筛选完的分子一旦进入下一步的验证，实验还发现有表型，那这个闭环就达成了；一批筛选有可能达成让好几届学生从其中“寻宝”毕业的财富
- 第二轮的筛选发生在做机制的时候，不是每个人都有条件做机制就筛选分子的，但是如果有条件筛，以筛分子作为起点的话，机制做不出来几乎是不可能的，总能做出一些故事来
- 高通量筛选是非常流行的基础研究策略，先提出一个问题，然后进行筛选，从中获取candidate
- 市场上会有一些优质的产品，对于LncRNA和编码基因都有设计探针，这样一次可以读出两个水平的序列
研究选题的问题
- RNA可以根据生理功能进行分类
- 对Non-coding RNA进行进一步的分类
- 在医学科研的领域，主要关注Regulatory RNA中的miRNA、LncRNA和circRNA
- 起点比较低的选手可以先从miRNA开始，并不推荐从LncRNA和CircRNA开始
- LncRNA根据转录的位置可以进行进一步的分类
- 基因间lincRNA很可能是有自己单独的启动子的
- intronic LncRNAs内含子LncRNA常常和功能基因共用启动子
- 如果上游还要做转录调控，那同等条件下更加推荐去做lincRNA
- Antisense LncRNA的主要作用是与其周边的基因存在顺式调控作用，这个见三十六策的内容
- 做LncRNA，其亚细胞定位（细胞核还是细胞质）是非常重要的，直接影响到了我们研究分子机制的套路
- 补充：mRNA的研究套路
- RNA编辑
- 可变剪接
- 相对来说比较高阶的技巧，见后
