功能基因研究套路 Lesson 7 肿瘤样本研究套路

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• TCGA数据库是一种比较专业的，主要面向生物信息学专业工作者的数据库，它的整个界面并不是非常的友好，对于学生物学/临床医学的学生来讲，TCGA数据库的界面远没有Oncomine数据库那样有好，下载方式也比较困难
• Oncomine数据库的优点：界面友好，操作简便，有多重数据来源，已经包含了TCGA数据库的内容
• Oncomine数据库使用前，是需要邮箱注册的，只有非赢利性邮箱，比如学校的.edu邮箱才可以用于注册；商业性邮箱是不可以的
• 解决非赢利性邮箱的方法：自行淘宝
• 因Oncomine数据库于2022.1已经停止服务，本文不再记述该数据库的使用方法

分析基因表达差异

• 没有课题的时候解决选题的来源
• 有靶基因的时候增加数据佐证

分析临床相关性证据

• 针对基因表达和预后进行分析
• 针对病理特征相关性进行分析

分析基因共表达

• 分子机制研究用来探索方向
• 共表达分子构建信号通路网络