- 常见的信号通路网站，以迅速掌握信号通路中的关键内容
- 首先要掌握的是信号通路的主体内容，以及信号通路中关键分子起到的作用，以及彼此之间的调控关系
KEGG网站
- KEGG：Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
- 由日本京都大学生物信息学中心的Kanehisa实验室于1995年建立，是国际最常用的生物信息数据库之一
- KEGG以“理解生物系统的高级功能和实用程序资源库”著称
- 图例
- 图中最左边的两条竖线：细胞膜
- 箭头：促进；T形结尾的箭头：抑制
- +p：磷酸化
CST pathway数据库
- CST：Cell Signaling Technology，本身是生物科技公司
- CST官网-研究-CST通路
- 缺点：无法根据关键字进行查找，搜索栏是没用的
- 如果一定要找，可以用快捷键“Ctrl/Cmd+F“，但是这种方法只能查找页面内的关键词，如果关键词不在页面内就无效了
- 没有收录FOXO信号通路
- 信号通路图是可以下载的，信号通路图中的每一个蛋白也都是可以点击进入的，进入之后可以看到与这个蛋白相关的所有产品
- 优点：提供了中文，信号通路图非常精美，可以用在做报告的时候，或者展示自己的工作，可以提升美学效果
- 缺点：收集的信号通路不是特别全，查找也不是很方便
BioCarta数据库
- 在整合了KEGG（更新到了2006年9月5日的版本）的基础上，还有自己特有的信号通路
- KEGG信号通路的版本比较陈旧，不建议使用了
- 可以使用”Pathway Searcher”对BioCarta自带的数据库进行检索
- 图片精美，而且和KEGG数据库的侧重点不太一样，对于KEGG而言，追求的是每条信号通路的“大而全”，而BioCarta在制作信号通路图时，是有选择的，会主要显示主干的信号通路，而细节的信号通路会被隐去。
- 对于初学者而言，学习BioCarta数据库可以迅速掌握信号通路中的主干部份，有利于提高学习效率
