功能基因研究套路 Lesson 14 论文题目技巧

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标题

• “庖丁解牛”的故事——中国古代的“还原论”/“模块化思想”

  文章标题是研究内容的高度凝练，是研究内容组合形成的
  论文的标题并不需要费劲心思去考虑，而是把自己的研究内容进行高度概括，然后排列组合关键词，在关键词之间加上连词和副词使其通顺就可以了

标题的组成部份

• 研究对象
• 疾病
• 表型
• 信号通路
• 功能/作用
• 模型
• 六个要素不需要在标题中全部包含，4-5个也是可以的，有的时候3个都可以

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对于这篇文章的分析

• 作为一篇IF=5的文章，研究的层次很多，工作量也很大

复习这篇文章讲了什么

• 通过TCGA数据库，下载了大量公开的数据，然后通过数据分析，发现CISD2这个分子在胃癌组织中高表达，而在癌旁对照组织中表达很低
• 同时，免疫组化IHC也证实，CISD2在癌症组织和癌旁组织中，是有存在显著差异的
• 接着，通过TCGA数据进行了生存曲线的分析，也证实CISD2高表达的患者预后比较差，CISD2低表达的患者预后比较好，证实CISD2具有称为患者预后marker的潜能
• 通过细胞模型和动物模型两个层面的研究，研究了和肿瘤相关的表型，包括MTT增殖实验、细胞周期实验、克隆形成实验，锚定非依赖的增殖实验
• 作者为了深入研究CISD2在胃癌细胞中发挥的机制和作用，通过GSEA数据库的分析发现，分析GSEA的表达与Akt/FOXO通路有高度的富集效应，研究者也通过qPCR、western和luciferase assay证明了Akt信号通路确实参与介导了CISD2的功能

解构1

• 对应的段位：刚刚接触科研的学员+所在的实验室科研基础没有很雄厚+经费没有很充足，也就是没钱做大规模的基因筛选或二代测序
• 充分利用网络上公开的数据库进行数据挖掘是很好的选择，例如这篇文章的研究者可以只进行TCGA数据库的分析+IHC的验证，同时根据TCGA数据库提供的数据进行了生存曲线的分析，那么对应的标题应该修改如下
  

解构2

• 对应的段位：实验室对于生物信息学不是特别擅长+实验室经费没有特别支持，不足够找专业的公司进行专业的生物信息学数据挖掘
• 在这样的情况下，研究人员只能通过查阅文献找到CISD2这个分子，在本实验室或者本科室的研究模型下，研究CISD2的功能和作用，并且通过细胞模型和动物模型，研究CISD2的表型，并且深入研究下游CISD2的信号通路
• 这样的情况下，对应的标题修改如下：
  
• 六要素完全的题目可能太长了，我们可以适当舍弃一个要素，下面提供两种选择
  • 舍弃研究的模型：
    
  • 舍弃分子的功能和作用：（也能通过暗示的方式让作者get到隐藏的信息）
    
• 进一步精简的“四要素标题”，也就是把研究模型和分子功能都省略掉
  

解构3

• 对应的段位：初学科研的小伙伴+不太擅长机制研究+只能做细胞和动物层面的简单表型研究=对分子机制完全没有涉及
• 撰写标题时仍然采用六要素法，得到一个五要素的结果
  
• 简化成四要素的版本
  • 省略模型：
    
  • 舍弃分子的作用和动能，通过暗示的方法进行
    
• 最简约的三要素方式：