回顾&引入
- 在三十六策 Lesson 13中，我们探讨了二元变量关系，有四种常见变量搭配方式。然后从二元进化到三元，把一项研究的框架设计提升到了“上可追溯驱动因素，下可解释效应机制，分子变量坐镇中路”的完美故事结构。把“我是谁、从哪来、到哪去”的三大问题全部解决， 逻辑上表现得条理清晰，层次分明
- 在三十六策 Lesson 14中，我们学习了最基本的三元变量组合: 药物+分子+通路，这个组合里三种变量都有，像个全家桶，品种很齐全。
- 这一策我们继续修炼，深入地领略一下分子作为变量，一式三份，也就是上中下游各一个分子的研究套路的操作细节。分子+分子+分子是最难的三元组合， 如果把最高阈值突破了，往下兼容就是水到渠成了。
- 三元变量按照排列组合来说一共有3^3=27种之多，不可能一一讲解，学完经典的“药物+分子+通路”和“分子+分子+分子”，剩下的要会自己类推。别看有27种，但们内在要解决的二元搭配逻辑关系只有4种，就是前面讲过的二元变量组合:1)已知药物找分子;2)已知药物找通路;3)已知分子找通路;4)已知分子找上下游的分子。把这四个问题的思路理清楚了，所有的三元变量关系都可以依次推导出来了
三元变量的最上游：药物或分子
三元变量的最下游：分子或通路
三元变量的中间：一般是分子，而且最好把创新放在分子上，用分子最富有变化的特性，串联起一个情节完整的故事
三元变量中的“先下后上”
- 当我们面对分子的一元三形可上也可下的时候，要记住一条口诀：先下后上，即先做下游，后做上游
- 对于一个分子，首先回答“为什么这个分子会调控下游的某个表型”的问题，再回答“什么因素引起了这个分子的变化”的问题。
三元变量的分析结构
举例
- 假说：在疾病中，老鼠（中间变量）消耗大米（下游变量）导致人饥饿（表型），猫（上游变量）可以抑制饥饿
- 研究背景：大量研究证明“米的多少和人会不会挨饿是相关的”，研究者的创新发现是“老鼠和人饿不饿有关系”
单变量论证
- 老鼠与饥饿的关系：“表达差异，正反回复，细胞动物”
- 得到结论：“老鼠能够促进人饥饿”
二元变量论证
- 首先论证下游变量：也就是老鼠与米之间的关系：过表达或沉默鼠，观察米的变化，增加老鼠，大米变少，结合之前的研究，人当时是饿的，推断老鼠可能通过影响大米导致人饿
- 这里可以适当简化研究，选一个方向就可以，不一定非要正+反
- 接着论证上游变量：加入猫（药物）；或者过表达/沉默猫（分子），观察鼠的变化，还可以顺带检测米的变化，上一步有结论，这一步也可以顺带验证一下下游的变量是不是一致
Rescue
- 先做下游：沉默鼠+沉默米，观察人饿的表型，like“米不动，鼠动也白动”，当然，这个rescue的方向也能换成同时过表达鼠+过表达米，具体选择推荐选择围绕主变量，有治疗效果的方向，比如说沉默鼠有利于缓解人饿的表型，那我们就选沉默鼠的，在逻辑上更完美
- 再做上游：加猫的同时加鼠，观察人饿的表型。这里选择和上游相反的方向，更能突出“一正一反”的策略，为文章增色
- 从文章增色角度，对于主变量，在做下游的时候选择有治疗效果的方向，做上游的时候反过来更容易为文章增色；从操作角度，主变量上游和下游变化的方向一致更加省事，可以自己斟酌
可选的增色内容
- 做直接机制
- “猫怎么吃老鼠，刺身还是烧烤”
- “鼠怎么吃米，炒饭还是米粉”
总结的论证套路
多元变量的简并思想
多元变量的简并思想在超过三元的变量组合中特别重要，在高分文章里面有时候变量会特别多
在多元变量里，围绕主变量的三元才是真正的逻辑核心，其他内容都是支线剧情，主次有别、化繁为简。
举例：耐药表型的“伪三元结构”
- 把耐药看成一个表型
- 药物+分子=等同于=以分子为主变量，耐药为表型的单变量
- 这种课题里，分子+通路/下游调控的靶分子， 看上去就像是药物+分子+通路或药物+分子+分子的三元结构，但实质上可以简化为耐药表型的分子+通路或者分子+分子二元结构
擒贼先擒王，先把主变量识别出来
- 一篇文章有且只有一个主变量，这是逻辑要点。
- 重点关注的：围绕这个主变量，谁是它的直接下游?或者说最近的间接下游；谁是它的上游?包括直接和间接作用
- 主变量的的上游的上游、下游的下游，统统划归支线任务，可以采取简化的论证模式来处理
- 简化的方式：
- 支线只需要验证调控关系，一般不做Rescue
- 已有报道的变量关系，常规引用文献就可以了， 可以省略论证步骤
- 高分文章的论证工作量一般都是过量的，除了正文补充材料还有一大堆。作者会把整个 Story 的方方方面面尽量考虑得比较完整。
- 当我们发现主变量调节下游因变量一个明星分子的时候， 它是明星，就肯定有已知的下游，那么顺水推舟把下游的下游也验证了，从小明星到大明星或者从大明星到另一个大明星形成双子星，都是把故事讲得更完整的策略。上游同样也是这样。
- 而且，好文章审稿人更可能会刨根问底，具体指的是间接作用和直接作用还有区别，间接作用审稿人不但会问下游的下游，还会问下游的上游：怎么确定不是因为上游某个已知分子的变化，引起下游靶分子变化呢?要排除就要验证。所以间接机制往高分走有逻辑缺陷，到这个程度还不如索性做直接作用机制。直接机制没有下游的上游问题，只有下游的下游、 上游的上游这些环节，围绕主变量三元适当扩充一点就能让审稿人满意了。
